Tradisi ini juga menunjukkan bahwa masyarakat Yogyakarta percaya adanya kekuatan-kekuatan gaib yang berpengaruh terhadap kehidupan manusia, seperti Ratu Laut Selatan, Eyang Empu Romo, Eyang Empu Ramadi, Eyang Panembahan Prabu Jagad, dan lain-lain.
Labuhan Merapi juga merupakan salah satu cara masyarakat Yogyakarta untuk menjalin hubungan harmonis antara manusia, alam, dan Tuhan.
Dengan melakukan Labuhan Merapi, masyarakat Yogyakarta berharap mendapatkan perlindungan, keselamatan, dan kesejahteraan dari Tuhan melalui perantara Gunung Merapi dan para penunggu dan penjaganya.
Labuhan Merapi juga merupakan bentuk pengakuan dan penghormatan masyarakat Yogyakarta kepada Keraton Yogyakarta sebagai pemegang otoritas adat dan kebudayaan di wilayahnya.
Labuhan Merapi adalah salah satu tradisi kebudayaan yang tetap lestari hingga sekarang di Yogyakarta. Tradisi ini menunjukkan kekayaan dan keunikan budaya Jawa yang bersinergi dengan nilai-nilai Islam.
Tradisi ini juga menunjukkan kearifan dan kesadaran masyarakat Yogyakarta dalam menjaga keseimbangan antara manusia, alam, dan Tuhan.