Pada September 1649, Cromwell mengirimkan pengepungan di Drogheda, kota di pantai Timur Irlandia, yang telah diduduki oleh koalisi Katholik Roma, Sekutu dan Pendukung negara yang ingin mengeluarkan warga Inggris dari Irlandia.
Pasukan Cromwell tidak menunjukkan belas kasihan, dan seluruh 2800 pasukan pertahanan Drogheda dibantai secara massal.
Di akhir abad ke-17, melawan latar belakang sengketa yang kemudian semakin memperumit hubungan kedua populasi, posisi Katholik sangat dikompromasikan.
Memang, Perang Boyne (1690) yang menyebabkan Raja Katholik James II dikalahkan oleh Raja Protestan William III, mengamankan supremasi Protestan.
Undang-undang baru terbentuk yang membatasi kepemilikan properti Katholik lebih jauh lagi, bersama dengan membatasi hak mereka pada pendidikan, menjadi tentara dan warga Irlandia dipaksa keluar dari pekerjaan juru tulis.
Bahkan bagi yang tampaknya tidak terdampak oleh hukum, faktanya merasa harga dirinya tercoreng juga karena tanah mereka menjadi milik warga asing.
Akhirnya, pergerakan reformasi 'patriotisme' terbentuk, yang dimulai untuk melobi agar bisa berpidato di Parlemen.
Saat itulah suara nasionalisme Irlandia pertama sudah dibuat.