Dia memulai pelatihan pilot pada Agustus 1940, lalu menjadi perwira pada Mei 1941, dan menyelesaikan pelatihan operasional dan navigasi.
Sebagai seorang pilot berbakat, Manser melakukan segalanya dengan baik di RAF.
Keterampilannya terlihat, dan dia menghabiskan waktu sebagai instruktur dengan unit pelatihan RAF.
Pada April 1942, ia kembali ke Skuadron 50, aslinya adalah kelompok pembom.
Dia terus membuktikan kemampuannya sebagai komandan sekaligus pilot dan dipromosikan menjadi perwira terbang pada 6 Mei.
Di Skuadron 50, Manser diberi tugas menerbangkan bomber Manchester. Itu sebenarnya bukanlah prospek yang menyenangkan.
Menjelang Perang Dunia II, Inggris kekurangan bom dan pesawat yang cukup besar untuk melakukan penghancuran yang diharapkan RAF.
Eksperimen dilakukan dengan pembom baru, dan Manchester adalah salah satu hasilnya.
Didukung oleh sepasang mesin Rolls-Royce Vulture dan dibangun di sekitar teluk bom yang sangat besar, Manchester memegang janji besar.
Namun, tenaga yang dihasilkan jauh lebih sedikit dari yang diharapkan dan ada masalah dengan pelumasan.
Pesanan sebenarnya untuk 1.200 Manchesters dibatalkan setelah 200 telah diproduksi.