"Sementara mengutuk tindakan ini, Iran menekankan perlunya masyarakat internasional dan Badan Tenaga Atom," katanya.
"Dalam menangani teroris nuklir ini dan memiliki hak untuk bertindak melawan pelaku," imbuhnya.
Israel, tak terima dan menuduh Iran berusaha membangun senjata nuklir untuk melawannya, tetapi Iran belum memberikan komentar resmi.
Tetapi pada sebuah upacara pada 11 April dengan para pemimpin militer dan intelijen menjelang peringatan 73 tahun Israel minggu depan.
Perdana Menteri Benjamin Netanyahu mengatakan perang melawan nuklirisasi Iran adalah tugas besar.
Insiden di Natanz terjadi sehari setelah Iran mulai menjalankan mesin sentrifugal canggih di Natanz.