Dia lulus dari Akmil pada 1985.
Setelah lulus dari Akmil, Doni langsung bergabung dengan korps baret merah, Kopassus, pada 1986-1998.
Dia pernah bertugas di wilayah konflik Timor Timur, Aceh, dan beberapa daerah lainnya.
Selanjutnya pada 1999-2001, Doni sempat ditugaskan di Batalion Raider di Bali.
Setelahnya, dia kemudian dirotasi dan bergabung dengan Paspampers.
Pada 2008, Doni dipromosikan menjadi Komandan Grup A Paspamres, grup yang bertanggung jawab langsung terhadap keamanan kepala negara.
Total selama bertugas sebagai paspampres, Doni pernah mengikuti kunjungan Presiden hingga ke-27 negara di dunia.
2010-2011, Doni ditugaskan untuk posisi teritorial sebagai Danrem 061/Surya Kencana, Bogor.
Beberapa bulan setelahnya, dia ditugaskan kembali ke Korps Baret Merah dan ditunjuk sebagai Wakil Komandan Jenderal (Wadanjen) Kopassus.
Saat itu, Doni ditugaskan oleh Presiden Susilo Bambang Yudhoyono (SBY) untuk menjadi Wakil Komando Satuan Tugas untuk pemberantasan Kapal MV Sinar Kudus yang dibajak perompak Somalia.
Setelahnya, karier Doni semakin melejit.
Dia lalu diangkat menjadi Komandan Paspampres pada 2012-2014.