Menurut hikayat Bacan, raja yang pertama berkuasa adalah Said Muhammad Bakir atau Said Husin, yang setelah 10 tahun memerintah digantikan oleh Muhammad Hasan.
Selanjutnya, takhta kerajaan diberikan kepada putranya, yakni Kolano Sida Hasan.
Di masa pemerintahannya, Raja Ternate yang bernama Tulu Malamo (1343-1347) merebut Makian beserta beberapa desa di sekitar Pulau Bacan.
Dengan bantuan Tidore, Sida Hasan merebut kembali daerah Makian.
Selanjutnya, tidak diketahui nama-nama raja yang memerintah Bacan.
Barulah pada 1522, muncul nama Zainal Abidin, yang disebut sebagai raja Bacan pertama yang memeluk agama Islam.
Raja-raja Kesultanan Bacan
- Said Muhammad Bakir/Said Husin (1333-1343)
- Muhammad Hasan (1343)
- Kolano Said Hasan (1343-...)
- Zainal Abidin (1522)
- Kasiruta/Bayanu Sirullah