Divisi Prinz Eugen juga terlibat dalam perlucutan senjata terhadap pasukan Italia, yang berlangsung pada musim panas 1943.
Namun kendati para gerilyawan yang dipimpin Tito itu terus dikejar-kejar hingga tahun 1944, pasukan Gebirgs Division tetap belum mampu meringkusnya.
Pasukan Division Prinz Eugen yang kemudian bertempur bersama pasukan SS yang diterjunkan dengan parasut akhirnya berhasilkan menghancurkan pasukan Tito (1st Partisan Division) dalam pertempuran yang berlangsung di kawasan Dravar.
Tapi ketangguhan pasukan Prinz Eugen akhirnya menemui batunya juga.
Ketika pasukan Uni soviet yang sukses melancarkan serangan balik mulai memasuki kawasan Balkan, Gebirgs Division akhirnya mendapatkan musuh yang seimbang dan bahkan terdesak oleh pasukan Uni soviet.
Memasuki tahun 1945 bahkan terjadi titik balik. Pasukan Nazi Jerman dan Gebirgs Division yang bertempur di kawasan Balkan akhirnya makin terdesak.
Banyak anggota Prinz Eugen yang memilih melepas seragam dan senjata lalu melarikan diri ke arah Eropa Barat untuk menyelamatkan diri.
Rupanya karena bukan merupakan orang Jerman asli para pasukan Prinz Eugen semangat tempurnya langsung memudar begitu menyadari akan menderita kekalahan.
Tapi sebagian di antaranya berhasil dihadang pasukan gerilya Tito dan kemudian terpaksa menyerahkan diri kepada musuh yang semula dikejar-kejarnya itu.
Sejumlah personel Prinz Eugen bahkan langsung dieksekusi oleh para gerilyawan Tito sebagai aksi balas dendam.