Kapal itu meninggalkan pelabuhan, namun tidak pernah terlihat lagi.
Ada banyak spekulasi tentang apa yang terjadi di Madagaskar.
Satu teori adalah bahwa wol di kapal terbakar secara spontan, tragedi seperti itu pernah terjadi sebelumnya.
Ada kemungkinan kapal itu hancur karena gelombang aneh atau, seperti Titanic, tenggelam setelah bertabrakan dengan gunung es.
Ada juga kepercayaan yang berkembang bahwa penjahat di kapal, tidak terdeteksi oleh polisi di pelabuhan, telah menyabotase kapal.
Tetapi penjelasan yang lebih masuk akal adalah bahwa kapal itu adalah korban bajak laut yang menenggelamkan Madagaskar setelah mengambil hartanya.
Pada tahun 1997 peneliti Australia Gerald Crowley menemukan artefak, pisau, sendok, paku, dan sebagainya, di atol terpencil Anuanuaro di Polinesia Prancis.
Dia meyakini bahwa artefak yang ditemukan itu berasal dari kapal Madagaskar.
Baca Juga: Kapal Mary Celeste, Kapal yang Nyaris Sepanjang Hidupnya Tertimpa Sekaligus Membawa Kesialan