Sakharov pun diperbolehkan kembali ke Moskow dan menjadi salah satu tokoh reformasi.
Andrei Sakharov membantu menyusun konstitusi baru setelah terpilih menjadi anggota parlemen pada tahun 1989.
Pada akhrinya, dia meninggal 14 Desember 1989 karena serangan jantung.
Penghargaan Sakharov Parlemen Eropa
Parlemen Eropa pada 1988 menetapkan Penghargaan Sakharov untuk Kebebasan Berpikir yang diberikan setiap tahun untuk menghormati aktivis dan fisikawan Soviet itu.
Penghargaan pertama diberikan kepada oposan Rusia Anatoly Marchenko dan revolusioner Afrika Selatan Nelson Mandela.
Sementara di Rusia sendiri tidak ada monumen untuk Sakharov, berbeda misalnya dengan penemu senapan AK-47, Mikhail Kalashnikov.
Namun, sebuah jalan besar di Moskow disandang dengan namanya.