Pada bulan Nopember 1951, Alex Kawilarang diangkat sebagai Komandan Teritorium III Jawa Barat dengan pangkat Letnan Kolonel.
Pada saat inilah Alex Kawilarang memprakarsai dibentuknya Kesatuan Komando yang terlatih bertempur dalam satuan-satuan kecil yang serba bisa dan dapat diandalkan.
Sebagai Panglima Divisi Siliwangi ia terjun langsung dalam penumpasan gerombolan Darul Islam pimpinan Karto Suwiryo.
Alex Kawilarang diangkat sebagai Atase Militer di KBRI Washington hingga tahun 1957.
Ia selanjutnya mengajukan pengunduran diri karena tidak setuju dengan kebijaksanaan pemerintah pusat dalam menangani kasus Permesta.
Sejak saat itu namanya sering dicantumkan sebagai Kepala Staf Angkatan Perang PRRI/Permesta.
Salah satu tingkah Alex Kawilarang yang paling diingat adalah ketika dia dikabarkan pernah menampar Soeharto.
Dilansir dari surya.co.id pada Minggu (22/11//2020), kejadian itu terjadi saat Soeharto muda dan masih aktif di militer.
Saat itu juga, Alex Evert Kawilarang menjabat sebagai Panglima. Dan berarti ia berosisi sebagai atasan dari Letkol Soeharto.
Kisah penamparan Soeharto oleh Alex Evert Kawilarang ini ada dalam buku "Suharto and His Generals: Indonesian Military Politics 1975-1983' tulisan David Jenkins" tahun 1984.