Perusahaan perangkat lunak tersebut mengatakan sebuah kelompok peretas Rusia yang biasa dijuluki "Beruang Mewah" juga terlibat.
Microsoft mengatakan mayoritas targetnya adalah organisasi yang sedang dalam proses menguji vaksin Covid-19.
Dikatakan sebagian besar upaya pembobolan gagal, tetapi ada juga yang berhasil meski jumlahnya tidak ditentukan.
Express.co.uk memberitakan, Microsoft menolak menyebutkan organisasi yang menjadi target para peretas atau mengatakan organisasi mana yang berhasil diserang.
Eksekutif Microsoft Tom Burt berkata: "Kami pikir serangan ini tidak masuk akal dan harus dikutuk oleh semua masyarakat yang beradab."
"Kami berbagi lebih banyak tentang serangan yang baru-baru ini kami lihat dan mendesak pemerintah untuk bertindak."
Dia menambahkan, "Pada saat dunia bersatu dalam menginginkan diakhirinya pandemi dan dengan cemas menunggu pengembangan vaksin yang aman dan efektif untuk Covid-19, penting bagi para pemimpin dunia untuk bersatu demi keamanan institusi perawatan kesehatan kita dan menegakkan hukum terhadap serangan dunia maya yang menargetkan mereka yang berusaha membantu kita semua. "
Kedutaan Besar Rusia di Washington - yang telah berulang kali membantah tuduhan keterlibatan Rusia dalam spionase digital - mengatakan dalam sebuah email bahwa "tidak ada yang dapat kami tambahkan" pada penyangkalan mereka sebelumnya.
Rusia ingin meluncurkan vaksin Sputnik V-nya sendiri yang diklaim Kremlin 92% efektif dalam melindungi orang dari Covid-19 dalam uji coba sementara.
Perwakilan Korea Utara untuk PBB tidak segera menanggapi tuduhan tersebut, tetapi Pyongyang sebelumnya membantah melakukan peretasan di luar negeri.