Dalam pertukaran yang dirahasiakan selama bertahun-tahun, Kennedy mendiskusikan pilihannya dengan sekelompok penasihat pilihan, dengan mengatakan: “Jika kita membiarkan misil mereka tetap ada, mereka telah menyinggung martabat kita, dan berada dalam posisi untuk menekan kita.
“Di sisi lain, jika kita menyerang rudal atau menginvasi Kuba, itu memberi mereka garis yang jelas untuk merebut Berlin.”
Mendapatkan kembali bagian barat ibu kota Jerman lama telah menjadi prioritas Rusia selama bertahun-tahun.
Kennedy enggan mengorbankan tempat itu tetapi aset Perang Dingin yang sangat signifikan.
Tapi, katanya, tindakan Khrushchev hanya menyisakan satu pilihan yang tersisa: "yaitu menembakkan senjata nuklir — yang merupakan alternatif yang luar biasa."
Banyak penasihat militer Kennedy menganjurkan tindakan.
Invasi ke Kuba adalah pilihan yang disukai Kepala Staf Angkatan Darat Earle Wheeler dan dia mendesak perintah untuk menyerang.
Kennedy berpendapat bahwa blokade Kuba adalah tindakan yang lebih sepadan - dan bertahun-tahun kemudian dia terbukti benar: jika pasukan Amerika mendarat di tanah Kuba pada tahun 1962, mereka tidak akan bertemu dengan 10.000 tentara Soviet yang diprediksi CIA, tetapi sepenuhnya empat kali lipatnya.