Pertama, teori ini tidak menjelaskan secara rinci antara masuk dan berkembangnya Islam di wilayah ini.
Kedua, tidak ada penjelasan mengenai mazhab apa yang berkembang di Samudra Pasai.
Tidak heran ada banyak pertanyaan besar.
Misalnya mungkinkah saat Islam datang langsung mampu mendirikan kerajaan yang memiliki kekuasaan politik besar?
Oleh karenanya, teori Gujarat oleh Prof. Dr.C. Snouck Hurgronje tidak cukup untuk menjelaskan masuknya agama Islam ke Indonesia.
Selain Teori Gujarat, ada juga Teori Persia dan Teori Makkah.
Teori Persia mengatakan bahwa Islam masuk ke Nusantara pada abad ke-13 dengan dibawa oleh para pedagang Persia.
Dua tokoh yang mencetus teori Persia adalah Husein Djajadiningrat dan Umar Amir Husein.
Djajadiningrat bependapat bahwa tradisi dan kebudayaan Islam yang ada di Indonesia memiliki beberapa persamaan dengan Persia.
Contohnya, seni kaligrafi yang berpahat batu-batu nisan bercorak Islam di Nusantara.
Lalu, ada juga budaya Tabot di Bengkulu dan Tabuik di Sumatera Barat yang konon serupa dengan ritual yang dilakukan di Persia setiap tanggal 10 Muharram.
Kendati demikian, aliran agama Islam yang dianut di Persia berbeda dengan Indonesia.