APRIS berhasil menguasai wilayah-wilayah tersebut.
Tapi butuh berjuangan besar untuk menumpas pemberontakan RMS.
Maluku yang kaya rempah-rempah, menjadi target negara Eropa. Mereka ingin menguasainya.
Agar tidak jatuh ke tangan yang salah, Maluku segera menjadi bagian dari Indonesia.
Sayangnya bergabungnya Maluku ke NKRI tidak disetujui oleh sejumlah tokoh nasional asal Maluku.
Selain Soumokil, Manusama juga tidak setuju.
Mereka lantas mengikrarkan proklamasi RMS sehingga secara resmi Maluku terlepas dari NIT dan RIS.
Sikap Manusama itu membuat khawatir pemerintah pusat.
Apalagi ada dugaan pemberontakan RMS dibantu oleh tentang KNIL atau tentara Belanda.
Pada akhirnya, APRIS melakukan melakukan Operasi Malam.
Mereka mendaratkan pasukan sebanyak 850 orang untuk melawan pasukan RMS.
Saat itu, pasukan APRIS mendarat di Pulau Buru, Kai, Aru, dan Seram di Maluku Selatan.
Baca Juga: Latar Belakang Pemberontakan DI/TII dan Penangkapan Kartosoewirjo