"Kami prihatin bahwa mungkin ada perhatian lain kepada UNHCR dalam kelompok itu," kata Yante Ismail, juru bicara badan tersebut, kepada Reuters.
Kelompok hak asasi manusia telah meminta Malaysia untuk membatalkan deportasi tersebut, dengan mengatakan itu akan membahayakan orang yang dideportasi.
Beberapa orang yang dideportasi termasuk orang-orang dari komunitas Muslim dan Chin Myanmar yang tiba di Malaysia karena melarikan diri dari konflik dan penganiayaan di negaranya.