Hampir kehabisan batu bara, kapal uap memisahkan diri dari konvoi utama dan melambat lebih jauh untuk dapat mencapai pelabuhan Irlandia yang netral.
Namun lautnya ganas, didorong oleh badai Atlantik yang telah mendorong dari Barat, membuat laju kapal menjadi sulit.
Dalam kondisi demikian dan dengan kepala uap penuh, kapal bisa mencapai kecepatan hingga 10,5 knot.
Dini hari tanggal 16 Februari, SS Gairsoppa ditemukan oleh Focke-Wulf FW200 Jerman yang berputar dua kali dan melaporkan posisinya.
Tepat setelah tengah malam, menurut buku catatan U-Boat Jerman, Gairsoppa dihantam dengan satu torpedo di sisi kanan, di pegangan no 2, dan tenggelam.
Dia masih tiga ratus mil (480km) dari tujuannya di Irlandia Selatan dan hanya ada waktu untuk meluncurkan tiga sekoci sebelum Gairsoppa jatuh dua puluh menit kemudian.
Dua kapal terbalik di laut yang deras, sekoci yang tersisa mengapung selama tiga belas hari sebelum terlihat di lepas pantai Cornish.
Lizard Point Lifeboat melaut dan hanya mampu menarik satu orang hidup-hidup dari laut, Perwira ke-2 SS Gairsoppa R H Ayres.
Dia dianugerahi MBE atas usahanya dalam mencoba menyelamatkan sesama awaknya. Dia meninggal pada tahun 1992.