Lalu, Margaret membuat sebuah keputusan bahwa dia tidak akan menikah dengan Townsend karena aturan gereja dan posisinya sebagai bagian dari kerajaan.
Meski masih saling mencintai, Margaret dan Townsend berpisah.
Setelah berpisah, Townsend menikahi wanita pewaris tembakau Belgia bernama Marie-Luce Jamagne yang dikatakan sangat mirip Margaret.
Sedang Margaret akhirnya menikah dengan seorang fotografer, Antony Armstrong-Jones di Westminster Abbey pada 6 Mei 1960 dan menjadi pernikahan kerajaan pertama yang disiarkan televisi.
Margaret adalah pelindung sejumlah organisasi dan amal, dia juga sangat bangga dengan dedikasinya pada seni, rumah sakit, militer, anak-anak dan hal lain yang menyentuh hatinya.
Dia dan Amstrong-Jones memiliki dua anak yaitu Davis dan Sarah.
Tanpa sadar (atau justru secara sadar), Margaret meratapi perkawinan yang tidak pernah terjadi dan membuatnya semakin gelisah.
Tahun 1966, dua tahun setelah kelahiran Sarah, Margaret dilaporkan memiliki hubungan singkat dengan ayah baptis putrinya, Anthony Barton.
Selanjutnya, surat-surat intim terungkap bahwa dia juga menghabiskan waktu dengan Robin Douglas-Home.