Seorang juru bicara Sekretaris Jenderal PBB Antonio Guterres mengatakan dia "sangat terganggu" oleh konfrontasi antara pasukan keamanan Israel dan Palestina dan perilaku beberapa polisi.
Juru bicara Gedung Putih Jen Psaki juga mengatakan gambar polisi yang memukul pelayat sangat mengganggu.
"Kami menyesalkan intrusi ke dalam apa yang seharusnya menjadi prosesi damai," katanya.
Otoritas Palestina dan Al Jazeera mengklaim Abu Aqla ditembak mati oleh pasukan Israel, sementara Israel mengatakan belum mungkin untuk menentukan apa yang terjadi dan bahwa dia bisa saja terbunuh oleh tembakan Palestina.
Sebuah laporan sementara militer Israel pada hari Kamis mengatakan tembakan fatal itu bisa saja berasal dari "tembakan besar-besaran dari orang-orang bersenjata Palestina", atau mungkin dari "beberapa peluru" yang ditembakkan oleh seorang tentara "ke seorang teroris yang menembaki kendaraannya".
Shireen Abu Aqla, seorang Palestina-Amerika berusia 51 tahun, adalah seorang koresponden veteran untuk saluran berita Arab Al Jazeera dan telah melaporkan konflik Israel-Palestina selama dua dekade.
Dia diberi kelangkaan pemakaman di kompleks Presiden Palestina Mahmoud Abbas pada hari Kamis, di mana peti matinya dibawa terbungkus bendera Palestina.
Presiden Abbas memberi penghormatan kepadanya, menggambarkannya sebagai "martir kata bebas" yang "mengorbankan hidupnya" untuk membela perjuangan Palestina.
Dia mengatakan Israel "bertanggung jawab penuh atas pembunuhannya" dan bahwa dia akan merujuk kasus itu ke Pengadilan Kriminal Internasional, yang menyelidiki potensi kejahatan perang.
Perdana Menteri Israel Naftali Bennett menuduh Abbas "melempar kesalahan ke Israel tanpa dasar apapun".
Abu Aqla berada di kamp pengungsi Jenin pada Rabu pagi untuk melaporkan serangan Israel.
Militer Israel mengatakan operasi itu untuk menangkap "tersangka teroris".
Dikatakan: "Puluhan pria bersenjata Palestina menembak dan melemparkan alat peledak ke arah tentara. Para prajurit menanggapi dengan tembakan ke arah orang-orang bersenjata dan tembakan diidentifikasi."
Jurnalis Palestina lainnya, produser Al Jazeera Ali Samoudi, tertembak dan terluka selama kekerasan tersebut.
Insiden itu terjadi pada saat ketegangan sangat tinggi antara Israel dan Palestina, setelah hampir dua bulan salah satu periode kekerasan paling mematikan dalam beberapa tahun.
Israel telah melakukan operasi di Jenin setelah gelombang pembunuhan orang Yahudi Israel oleh orang Palestina dan orang Arab Israel di Israel dan Tepi Barat.
Tujuh belas orang Israel dan dua orang Ukraina tewas dalam penusukan, penembakan, tabrakan dengan mobil dan serangan kapak.
Pada periode yang sama, lusinan warga Palestina tewas - termasuk penyerang yang ditembak mati saat melakukan serangan, atau militan dan warga sipil tewas selama serangan dan konfrontasi Israel.