Cohen telah diketahui juga menemani Netanyahu dalam perjalanan ke luar negeri, bertindak sebagai penasihat senior, menteri luar negeri dan utusan politik,.
Semua itu menimbulkan kritik bahwa Cohen telah merusak independensi dan netralitas politik Mossad.
"Hubungan kepercayaan yang sangat menguntungkan antara saya dan Perdana Menteri bermanfaat baik untuk operasi dari institusi, dan juga untuk pengembangan institusi, tetapi saya tahu secara pribadi bahwa saya membayar harga untuk itu," kata Cohen.
Menanggapi kritik, Cohen mengatakan bahwa "Jika Anda melihat argumen panas (dengan perdana menteri) di mana saya (menemukan) diri saya sendiri, harus membuktikan bahwa saya teguh pada pendirian saya, karena saya teguh pada pendirian saya... saya tidak bekerja untuk perdana menteri."
Cohen juga membantah bahwa Mossad sengaja mengadakan pertemuan dengan para pemimpin di Uni Emirat Arab seminggu sebelum pemilihan Maret 2021 di Israel sebagai sarana untuk meningkatkan dukungan bagi Netanyahu.