Kaidu meninggal pada 1301 dan beberapa orang mengklaim bahwa dia ingin Khutulun menggantikannya setelah kematiannya.
Ini tidak berjalan baik dengan saudara-saudaranya dan Kaidu digantikan oleh salah satu putranya sebagai gantinya.
Khutulun diperkirakan telah meninggal sekitar tahun 1306, hanya beberapa tahun setelah ayahnya.
Menariknya, karakter Turandot (dipopulerkan oleh komposer Italia Giacomo Puccini dalam opera dengan nama yang sama) dianggap terinspirasi oleh sosok Khutulun.