Mayor Jenderal Igor Konashenkov, juru bicara kementerian, mengatakan kepada Pentagon dan Angkatan Laut Kerajaan "untuk tidak menguji nasib dengan sia-sia".
Dia menambahkan HMS Defender "tidak lebih dari target" untuk pertahanan armada Laut Hitam.
Lebih dari 20 pesawat Rusia dan dua kapal penjaga pantai membayangi kapal perang Inggris saat berlayar di dekat Krimea.
Pada hari Rabu, Moskow mengklaim salah satu kapal patrolinya melepaskan tembakan peringatan di dekat HMS Defender.
Menteri Pertahanan Rusia juga mengklaim jet menjatuhkan bom di jalur kapal saat berlayar sekitar 12 mil jauhnya dari Krimea.
Pemerintah Inggris menolak laporan Rusia tentang insiden tersebut dan membantah bahwa ada tembakan peringatan yang telah ditembakkan.
Kementerian Pertahanan Inggris menambahkan dalam sebuah pernyataan: “Kami percaya Rusia sedang melakukan latihan meriam di Laut Hitam dan memberi komunitas maritim peringatan sebelumnya tentang aktivitas mereka.