Perairan lautnya mempunyai konfigurasi dari datar sampai melandai ke laut. Beberapa di antaranya bertubir curam.
Kedalamannya bervariasi dengan bagian terdalam mencapai 1.044 meter.
Karena keindahan alam dan kejernihan airnya yang begitu memesona, menyelam di Wakatobi serasa menyelam di Mega Aquarium.
Hampir tidak ada tempat yang lowong dari terumbu karang.
Dengan jarak pandang yang bisa mencapai 100 meter, ke mana pun mata memandang selalu terlihat ikan-ikan cantik yang berenang-renang.
Terdapat banyak titik penyelaman di Wakatobi. Salah satunya dan yang menjadi favorit banyak penyelam ada di kawasan Pulau Tomia yang bernama "Mari Mabok".
Nama tersebut diambil karena saking bagusnya pemandangan alam yang terhampar. Sehingga tempat itu sering membuat para penyelam lupa diri seakan-akan mabuk.
Di Pulau Tomia terdapat sebuah resort yang sangat terkenal yakni Wakatobi Dive Resort (WDR). Tingkat okupasinya luar biasa.
Tanpa booking terlebih dahulu, Anda jangan harap bisa mendapat tempat. Bahkan, biasanya, tempat ini sudah fully booked hingga tiga bulan ke depan.
Tapi, jika tak mendapat tempat di WDR, Anda tidak perlu cemas. Masih banyak resort-resort lain di Pulau Tomia. Salah satunya adalah Tomia Dive Center.